داخل خلية الخميرة تحدث عملية التنفس الخلوي، حيث تحوّل الخميرة السكر إلى طاقة تُستخدم في أنشطتها الحيوية. وقد يكون هذا التنفس هوائيًا إذا وُجد الأكسجين، أو لاهوائيًا إذا غاب الأكسجين.